您好,上海奕枫仪器设备有限公司!

Coriolis 应用:亚南极空气微生物的每日更替

发布人: 来源: 发布时间:2026-08-09 21:58:48


导读 在低温、偏远、低生物量的亚南极环境中,空气微生物的采集与解析面临采样体积、样本回收、液体冻结和方法学偏差等多重挑战。Malard 等人在南乔治亚岛开展了为期两周的近地表空气微生物时间序列研究。研究显示,空气细菌群落每天可发生高达 90% 的组成更替,同时仍保留 10-20% 的稳定核心微生物组。Coriolis Micro 与 Coriolis Compact 在该研究中分别承担“湿式高流量快照”和“干式长时积分”的角色,为极端环境空气生物气溶胶采样提供了有代表性的组合方案。

一、背景介绍:在低生物量空气中寻找微生物迁移的线索


空气并非只是物理颗粒和气体的混合物,也承载着细菌、真菌、病毒、孢子、花粉及其遗传物质。对农业病害传播、公共卫生、生物安全、室内空气质量和生态系统连通性而言,空气生物气溶胶都是不可忽视的监测对象。


极地和亚极地环境尤其特殊。一方面,它们被海洋环流、大气环流和极端气候隔离,空气微生物浓度低、采样窗口有限;另一方面,气候变化正在改变风场、降水和局地生态位,可能影响外源微生物进入、沉降和定殖的机会。因此,如何在偏远、寒冷、低生物量环境中稳定获得可用于分子分析的空气样本,是这类研究能否深入推进的关键。


本研究选择南大西洋亚南极的 South Georgia 作为天然实验场,在海岸站点 King Edward Point(KEP)与约 200 m 海拔的 Deadman’s Cairn / Lewis Pass(DMP)开展连续采样。两个站点分别代表局地生态源更强的海岸环境与更容易受气团输送影响的高海拔环境。


 

图1  南乔治亚 King Edward Cove 区域采样点分布及现场航拍图。DMP 为约 200 m 海拔站点,KEP 为海岸站点。



 

二、研究方法:两款Coriolis采样器构成互补采样窗口


研究团队于 2021 年 10 月 13-25 日采集 60 个空气样本和 5 个降雨样本,并同步整合温度、气压、风速和风向等气象数据。空气样本经 DNA 提取后进行 16S rRNA V4 区扩增子测序,部分样本进一步开展 shotgun metagenomics,用于解析空气微生物的分类组成、潜在来源和功能特征。

 
Coriolis Micro:湿式高流量快照。
研究中,Coriolis Micro 采样锥预装无菌 DNase/RNase-free H2O,以 300 L/min 流量运行。DMP 受电池条件限制,采样窗口为 180 min;KEP 有外接电源支持,采样时间延长至 6 h。采样结束后,液相样本经离心浓缩至约 1 mL,再进入 DNA 提取流程。其优势在于高流量、液相输出和下游快速分子分析兼容性,适合捕捉短时间窗口内的空气微生物“快照”。


Coriolis Compact:干式长时积分。
研究中,Coriolis Compact 以 50 L/min 流量运行,DMP 与 KEP 的采样时间分别为 180 min 与 6 h。样本首先以干式旋风方式沉积在无菌采样锥内壁;采样结束后,加入 1 mL 分子生物学级无菌水,vortex 60 s 重悬,再进入 DNA 提取流程。其优势在于无需预装采样液,可避免寒冷环境中液体冻结,更适合偏远、低生物量和需要较长积分时间的野外布点。
研究还设置 Welch 真空泵+滤膜作为对照方法,以 20 L/min 进行长时间过滤采样。三种方法共同构成了对采样体积、采样时长、样本形态和下游测序表现的比较基础。


 

图2  两款Coriolis采样器的应用方法与优势:Coriolis Micro 侧重湿式高流量快照,Coriolis Compact 侧重干式长时积分。



采样方案


 

三、结果:空气微生物群落高度动态,采样器表现形成互补


每升空气归一化后捕获到更高的 microbial richness 与 Shannon diversity;但这种优势依赖足够的采样时长,研究中至少运行 6 h 后更能体现。Coriolis Micro 则在较短采样窗口中提供高质量样本,尤其适合需要快速获得液相样本的分子检测流程。


 

图3  不同采样器在测序读数、richness/diversity、群落组成和不同门水平捕获表现上的比较。


 
地点差异同样显著。KEP 海岸站点受到海洋、野生动物、人类活动和周边陆地生态系统的共同影响,群落组成相对稳定,并可检测到更多宿主相关或海洋相关类群。DMP 高海拔站点的群落波动更大,偶发/瞬时类群占比更高,提示气团输送和远距离微生物扩散的影响更强。


时间维度上,研究观察到最高可达 90% 的每日群落组成更替;但仍有约 10-20% 的稳定核心微生物组持续存在。这一发现说明,空气微生物监测不能只依赖单次采样结果。短时高流量快照和长时间积分采样结合,能够同时捕捉瞬时波动与稳定核心。


气象因子进一步解释了这种动态变化。风向、温度、气压以及降雨事件均显著影响群落结构。降雨样本显示出更高 richness,并与同期空气样本形成差异;空气样本在降雨期间 richness 下降,支持“降雨洗脱/沉降空气微生物”的解释。


 

图4  关键发现与应用解读:空气微生物群落每日波动强烈,但存在稳定核心;Coriolis Micro 与 Coriolis Compact 适合不同时间尺度。


四、讨论:为什么Coriolis Micro与Coriolis Compact适合极端环境气溶胶研究?


第一,低生物量环境要求更有效的空气体积采集与样本浓缩。在亚南极这类空气生物量很低的场景中,采样器既要尽可能提高可分析样本量,又要避免采样过程引入污染或损失。Coriolis Micro 通过高流量湿式旋风将颗粒快速浓缩到液相,缩短了从采样到检测的链条;Coriolis Compact 通过干式采集延长采样窗口,提高了对稀疏空气微生物信号的捕获能力。

 
第二,寒冷和偏远环境要求采样方案更稳定、更低维护。湿式采样在极端低温下可能受到采样液冻结影响;干式旋风采样则降低了这一限制。Coriolis Compact 的便携性和续航能力,使其适合布设在无外接电源、运输条件受限或需要长时间连续采样的场景。


第三,研究型空气微生物监测需要区分“真实生态变化”与“方法学偏差”。论文结果显示,采样器本身会对捕获到的群落组成产生一定影响。因此,在长期监测或跨点位比较中,应尽量固定采样器型号、采样时间、采样液/重悬液、样本保存条件和下游分析流程;如果研究目标是同时解析短时波动与长时趋势,则可设计两款采样器的并行方案。
第四,两款采样器拓展了空气生物气溶胶应用边界。除极地生态学外,类似思路也可用于环境空气质量、病原气溶胶监测、生物安全、制药/食品生产环境控制、畜牧与兽医场景、室内空气微生物评估以及空气传播风险研究。


 

图5  应用场景矩阵:根据目标物、环境条件、采样时长和下游分析方法选择 Coriolis Micro、Coriolis Compact 或组合方案。


五、结论


这项南乔治亚研究证明,即使在寒冷、偏远、低生物量的亚南极环境中,只要采样策略、样本保存和分子分析流程设计得当,空气微生物群落的每日更替、稳定核心、局地来源和气象驱动都可以被系统解析。

 
Coriolis Micro 与 Coriolis Compact 的互补价值也因此更加清晰:前者适合高流量、短时、液相输出的快速空气生物气溶胶采样;后者适合干式、便携、长时、偏远低生物量环境的积分采样。对于未来的空气微生物监测,从单次采样走向连续时间序列,从单一设备走向按场景组合,将是提升数据解释力的关键。


Coriolis Micro 让空气微生物“快速进入液相样本”,Coriolis Compact 让偏远低生物量环境“实现更长时间的稳定采集”;两款采样器组合,为空气生物气溶胶从现场采集到分子解析提供了完整而灵活的工具链。