空气污染控制也是化妆品和食品行业的一个焦点，考虑到产品和生产区域，对特定的微生物污染物敏感，一些具体的生产要求非常严格的程序。我们可以拿奶酪Cheese工厂生产做例子，特定的的噬菌体（LactococcusXXX）如果其空气中的浓度过高，会耽误生产。

HACCP方法通常包括无菌区或层流罩控制空气污染监测过程监控，并帮助定义的关键点和实施适应的预防/纠正措施。

此外，奶制品和肉制品行业的区域尽量照顾要考虑环境因素，因为他们使用的是“活的原料”。